我局申报建立的北部湾二长棘鲷长毛对虾国家级种质资源保护区，被农业部于2008年12月22日审定公布（农业部公告1130号）列为63个国家级水产种质资源保护区之一。
北部湾海域海洋生物资源十分丰富，是南海具有高度物种多样性的代表性海域之一。北部湾渔业资源受渔业生态环境恶化和过度捕捞等因素影响，近年来一直呈衰退趋势，特别在东北部沿湾近岸面临的形势更加严峻，亟待采取有效措施加强保护。
北部湾二长棘鲷长毛对虾国家级种质资源保护区的建立，将进一步规范北部湾渔业资源环境保护工作，对于贯彻落实《中国水生生物资源保护行动纲要》，具有积极意义。下一步，我局将严格按照国家级水产种质资源保护区管理要求，建立健全保护区各项管理制度，完善管理系统和保护设施，加强行政执法管理，大力实施增殖放流等生态保护养护策略，积极开展水产种质资源多样性研究、保护区主要保护品种种群特征分析及北部湾海洋牧场试验等专题研究，逐步实现“全面保护北部湾渔业生态环境与水产种质资源”的总体目标。